雷神受命和华胥到昆仑山迎接女娲出生，中途遇到傲洪偷袭而受了重伤。雷神舍命降世女娲，华胥随夫跳崖而去，女娲受命东旅寻伏羲。
傲洪躲难于东海之中，并计劝龙王偷太阳，伏羲最终在龙王之女小龙女的帮助下救回太阳。小孽龙将小龙女偷偷到宛丘见伏羲之事搬弄是非，致使龙王大怒水淹宛丘。所有族人均在此灾难中逝去，唯有伏羲跳上其父雷神牙齿所变的金葫芦得救，并得雷神功力真传。
女娲被河伯捉入东海，伏羲为了救女娲而误入傲洪的黑旋涡，小龙女舍身进入黑旋涡救出伏羲女娲。伏羲女娲逃回宛丘，伏羲得知父母已逝，发誓要重建宛丘，除傲洪为父母报仇。
伏羲是天帝帝俊钦定的人皇，女娲是天帝帝俊钦定的人母。月老几番努力，终于为二人牵线，结为夫妻。此时，伏羲和女娲为了创造人类，盗来天火，创造出了一盏法力无边的宝莲灯，伏羲女娲受梦来到河边捏泥土借宝莲灯的法力造出九子，并定九子姓氏，授之技能，分发各方，成为华族中华大地繁华昌盛之始。伏羲和女娲造完人类后，来到了阐教圣地昆仑仙境乾元山金光洞，把宝莲灯变成金光洞内的莲花池，并将宝莲灯的口诀注入莲花池中，等待它的下一任主人。伏羲先后发明火、陶、结鱼网、创熟食，授种五谷，创文字、新年爆竹退年鬼、定婚嫁、定牡丹为国花，发明音乐，悟建茅屋等创造了一系列伏羲文化。
伏羲虽然创造了一系列的伏羲文化，但是他的妻子女娲后来怀孕十个月先后生了五个儿子和两个女儿，伏羲为他的五个儿子取名为后羿（即后来的玉皇大帝）、黄帝、如来、包拯、无天，伏羲为他的两个女儿取名为瑶姬、宓妃。
伏羲和女娲的长子后羿在五岁那年，被太上老君、元始天尊和通天教主带回天庭，后羿拜在太上老君、元始天尊和通天教主的门下，成了道阐截三教的大弟子，后羿在太上老君、元始天尊和通天教主的悉心教导下，学会了通天法力以及□□玄功和一个跟斗就能翻十万八千里的筋斗云，太上老君、元始天尊和通天教主更将如意金箍棒、打神鞭、长虹剑、盘古弓伏羲箭、雷峰塔五件法宝赐予后羿，后羿在天庭学艺的时候，在兜率宫里的八卦炉中锻炼出了三个天眼吊坠，自己的脖子上佩戴了一个，后羿还在八卦炉中锻炼了七七四十九天，练出了一双火眼金睛，转眼间，天界十五天，人间十五年过去了，后羿也长大成人了，太上老君、元始天尊和通天教主让他回到宛丘，后羿拜别三位师父后，含泪离开天庭回到了宛丘，去见他的父母伏羲和女娲，伏羲和女娲终于见到了他们的大儿子后羿，后羿还将另外的两个天眼吊坠给了他的妹妹瑶姬，此时，在天宫的天帝帝俊不理政事，惹的众仙无比愤怒，也导致了天帝帝俊后来死在了后羿的手中，人皇伏羲入主天庭，成为天帝，主宰天地人三界。</div>